Церковь Жен-мироносиц была построена в Великом Новгороде в 1510 году на месте, где располагалась деревянная церковь. Самая ранняя постройка на этой территории была каменная церковь, возведенная 1445 году. Строительством храма занимался московский купец Иван Сырков. Возвел церковь купец недалеко от дома, где он проживал. Святыня стала фамильной церковью купеческой семьи Сырковых, и первым архитектурным памятником города после присоединения новгородской земли к Москве.
После завершения строительства к церкви были пристроены приделы: Матфея Евангелиста и Сретения Господня. В складах церкви Жен-мироносиц в 16 веке находилась казна Ивана Грозного. В 1745 году храм был отдан Юрьеву монастырю, а 1832 году возвращен Сыркову монастырю по настоянию архимандрида Фотия.
Здание церкви состоит из трех этажей. Первый этаж, подвальный, расположен ниже уровня земли. Два следующих этажа играли роль складских помещений. Здание церкви выполнено в виде куба, который делился стеной от западной части храма.
После последней реставрации кровельное покрытие было выполнено из лемеха, что стало характерной чертой для построек того времени. Все многочисленные пристройки церкви относятся к разным временным рамкам.
На сегодняшний день здание церкви – это Детский культурный центр, в котором проводятся выставки, музыкальные концерты и фольклорные программы.