Недалеко от Юрьева монастыря, в небольшом поселении Перынь в ближайшем пригороде Великого Новгорода находиться один из самых маленьких храмов на Руси – церковь Рождества Пресвятой Богородицы.
История Перынского скита тесно связана с историей крещения Руси. Перынский скит расположен на полуострове (ранее был островом) при истоке реки Волхов из озера Ильмень, где в древности находилось капище славянского бога Перуна (отсюда и название этого места). Идола Перуна здесь воздвиг тот самый князь Владимир, который позже крестил Русь. После Киева он занялся крещением Великого Новгорода - второй своей столицы, и это крещение огнём и мечом происходило именно на острове Перынь, откуда был сброшен идол Перуна.
Православный храм на Перыне был возведён примерно в 12-13 веках, точных письменных источников сообщающих о дате постройки нет. Особенности кладки церкви, а так же ее стиль постройки позволили ученым определить примерную дату. Предполагается, что строительство было начато в 1226 году, когда в Великом Новгороде находился Александр Невский и в городе проходили выборы архимандрита. Подробное изучение церкви началось 1947 году в момент ее реставрации.
Церковь Рождества Пресвятой Богородицы, представляет из себя, одноглавый кубический храм, стены которого слегка сужаются кверху. Внутри здания находиться три свободных входа и широко расставленные столбы создают эффект большого и просторного помещения, этот метод применяют для небольших помещений, чтобы визуально расширить его. Надкупольных крест имеет форму полумесяца, но это не связано с мусульманской культурой. Такие кресты говорят о домонгольском периоде. В 19 веке, рядом с церковью были построены небольшие здания для монахов-отшельников, которые обитали в Перынском ските.
В советские годы здесь находилась туристическая база. В настоящее время скит Рождества Пресвятой Богородицы функционирует, вход беслплатный, а его настоятель иногда лично выходит к туристам и угощает их чаем.